Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKIV2LQ15477 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms