Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOMM20Q15388 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TOMM20Q15388 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms