Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF1Q15361 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms