Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCAPD2Q15021 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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