Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA3AQ14563 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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