Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBFBQ13951 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBFBQ13951 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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