Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3B2Q13367 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms