Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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PTPRSQ13332 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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PTPRSQ13332 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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PTPRSQ13332 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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PTPRSQ13332 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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PTPRSQ13332 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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PTPRSQ13332 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRSQ13332 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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