Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF5Q13243 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF5Q13243 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms