Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFEMP1Q12805 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFEMP1Q12805 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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