Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 MAK21YDR060W 3078 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 VPS33YLR396C 2076 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YBR259WYBR259W 2067 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 GWT1YJL091C 1473 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 MNT3YIL014W 1893 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 MUB1YMR100W 1863 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 SPO71YDR104C 3738 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 VPS3YDR495C 3036 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 RMD6YEL072W 696 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YIL141WYIL141W 390 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 DLS1YJL065C 504 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 MDV1YJL112W 2145 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 TMA19YKL056C 504 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 SUB1YMR039C 879 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 TIR2YOR010C 756 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 MRH4YGL064C 1686 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 TIF4631YGR162W 2859 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YDL180WYDL180W 1644 nt3.03□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 FRE8YLR047C 2061 nt3.02□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YFL012WYFL012W 447 nt3.02□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YKL069WYKL069W 543 nt3.02□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 URK1YNR012W 1506 nt3.02□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 EMP70YLR083C 2004 nt3.02□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 SIZ1YDR409W 2715 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YDR061WYDR061W 1620 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 MAK5YBR142W 2322 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YCR099CYCR099C 468 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YDL158CYDL158C 309 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 SLU7YDR088C 1149 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RPA14YDR156W 414 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 USE1YGL098W 738 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YHR180WYHR180W 492 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YKL070WYKL070W 510 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RAD33YML011C 534 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YNL109WYNL109W 546 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 MPD2YOL088C 834 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RIB4YOL143C 510 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 ENA5YDR038C 3276 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 GCN1YGL195W 8019 nt3.01□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 CDC37YDR168W 1521 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 CDH1YGL003C 1701 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RIF1YBR275C 5751 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 PSF1YDR013W 627 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RPB9YGL070C 369 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YGR115CYGR115C 780 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 AGE2YIL044C 897 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RPC37YKR025W 849 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 PRM6YML047C 1059 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RHO5YNL180C 996 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 PDR17YNL264C 1053 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RPC40YPR110C 1008 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RXT2YBR095C 1293 nt3□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 PKH1YDR490C 2301 nt2.99□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 BNI4YNL233W 2679 nt2.99□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RAD18YCR066W 1464 nt2.99□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.99□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 PUG1YER185W 912 nt2.99□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YGL039WYGL039W 1047 nt2.99□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 TPK3YKL166C 1197 nt2.99□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RRG7YOR305W 729 nt2.99□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 UBP8YMR223W 1416 nt2.99□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 NUR1YDL089W 1455 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 SPP382YLR424W 2127 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 BMS1YPL217C 3552 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 SLA1YBL007C 3735 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 GPM2YDL021W 936 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YDL071CYDL071C 375 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 UBC13YDR092W 462 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 CPR5YDR304C 678 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 SLD5YDR489W 885 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 EFG1YGR271C-A 702 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 DSE2YHR143W 978 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YLR076CYLR076C 423 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YKE2YLR200W 345 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 SSN8YNL025C 972 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YNL089CYNL089C 477 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 GIS2YNL255C 462 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RRP15YPR143W 753 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 POP7YBR167C 423 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 FUS2YMR232W 2034 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 FLO1YAR050W 4614 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 COP1YDL145C 3606 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YEL025CYEL025C 3567 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 NSE4YDL105W 1209 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RAV2YDR202C 1056 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YDR442WYDR442W 393 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YGL109WYGL109W 324 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 SGN1YIR001C 753 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 RPS21BYJL136C 264 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 CWH41YGL027C 2502 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM3Q12241 SRD1YCR018C 666 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM3Q12241 YDR203WYDR203W 318 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM3Q12241 EMI1YDR512C 564 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM3Q12241 HLR1YDR528W 1272 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM3Q12241 NSA2YER126C 786 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM3Q12241 TAD1YGL243W 1203 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM3Q12241 YJR020WYJR020W 333 nt2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.3 ms