Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 SSN8YNL025C 972 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 CMD1YBR109C 444 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 FAR1YJL157C 2493 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 VPS3YDR495C 3036 nt3.17□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 DIG2YDR480W 972 nt3.16□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 COG7YGL005C 840 nt3.16□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 OST5YGL226C-A 261 nt3.16□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 RIM9YMR063W 720 nt3.16□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 TSR4YOL022C 1227 nt3.16□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 VPS30YPL120W 1674 nt3.16□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 POL3YDL102W 3294 nt3.16□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 NMD2YHR077C 3270 nt3.16□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 PAM1YDR251W 2493 nt3.15□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 VPS33YLR396C 2076 nt3.15□□□□□ -1.9
VPS54Q12071 YPD1YDL235C 504 nt3.15□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 AI3Q0060 1248 nt3.15□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YGR017WYGR017W 894 nt3.15□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 VMA7YGR020C 357 nt3.15□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 ERG25YGR060W 930 nt3.15□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 PIR1YKL164C 1026 nt3.15□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RPL15AYLR029C 615 nt3.15□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RPL6BYLR448W 531 nt3.15□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 TPT1YOL102C 693 nt3.15□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RED1YLR263W 2484 nt3.15□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RMT2YDR465C 1239 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 SEC4YFL005W 648 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 SMX2YFL017W-A 234 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 MIG2YGL209W 1149 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RSM27YGR215W 333 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 PET54YGR222W 882 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 PHD1YKL043W 1101 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YLR169WYLR169W 354 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RPN13YLR421C 471 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 SRT1YMR101C 1032 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 PFY1YOR122C 381 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 PEX34YCL056C 435 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 SPO71YDR104C 3738 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YNL011CYNL011C 1335 nt3.14□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 POL4YCR014C 1749 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 HEH2YDR458C 1992 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 TIF4631YGR162W 2859 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 CHS2YBR038W 2892 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 GYL1YMR192W 2163 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 NRG1YDR043C 696 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 HTB1YDR224C 396 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YGL218WYGL218W 651 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RPC37YKR025W 849 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YOR387CYOR387C 621 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YKL222CYKL222C 2118 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 VAS1YGR094W 3315 nt3.13□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 DUF1YOL087C 3351 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YCR100CYCR100C 951 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 ERP3YDL018C 678 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YFH7YFR007W 1062 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YFR057WYFR057W 456 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YIL175WYIL175W 318 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YLL037WYLL037W 381 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 SPP382YLR424W 2127 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 SPC2YML055W 537 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YNL109WYNL109W 546 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YME2YMR302C 2553 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 MDM36YPR083W 1740 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 TRM82YDR165W 1335 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 TLC1TLC1 1301 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YAT2YER024W 2772 nt3.12□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 PIG2YIL045W 1617 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 TPO5YKL174C 1857 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RGC1YPR115W 3252 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 MPS1YDL028C 2295 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YDL050CYDL050C 372 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 MRH1YDR033W 963 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 MBB1YJL199C 327 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 UNG1YML021C 1080 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YBL055CYBL055C 1257 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 CAT5YOR125C 702 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 TPK2YPL203W 1143 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 ESA1YOR244W 1338 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 MUS81YDR386W 1899 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 TOM70YNL121C 1854 nt3.11□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YCG1YDR325W 3108 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YDL032WYDL032W 312 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 HMF1YER057C 390 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YGL230CYGL230C 444 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 COX6YHR051W 447 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 THP2YHR167W 786 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YJL114WYJL114W 681 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YKL091CYKL091C 933 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RPL8BYLL045C 771 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 SDO1YLR022C 753 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 ENV10YLR065C 546 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 PRM6YML047C 1059 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 YSF3YNL138W-A 258 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 RFC5YBR087W 1065 nt3.1□□□□□ -1.91
VPS54Q12071 GIS4YML006C 2325 nt3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms