Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GOLGA3Q08378 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms