Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RPS29P62273 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RPS29P62273 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS29P62273 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS29P62273 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RPS29P62273 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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