Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP46P62068 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP46P62068 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP46P62068 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP46P62068 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP46P62068 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP46P62068 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP46P62068 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP46P62068 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms