Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFRD-1P60508 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFRD-1P60508 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms