Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC13P55735 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC13P55735 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC13P55735 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC13P55735 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC13P55735 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SEC13P55735 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC13P55735 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC13P55735 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC13P55735 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEC13P55735 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC13P55735 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC13P55735 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC13P55735 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEC13P55735 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms