Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPHP49418 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPHP49418 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPHP49418 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPHP49418 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPHP49418 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPHP49418 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPHP49418 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPHP49418 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPHP49418 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPHP49418 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPHP49418 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPHP49418 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPHP49418 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPHP49418 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPHP49418 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPHP49418 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPHP49418 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPHP49418 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPHP49418 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPHP49418 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPHP49418 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPHP49418 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPHP49418 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPHP49418 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPHP49418 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPHP49418 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPHP49418 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPHP49418 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPHP49418 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPHP49418 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPHP49418 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPHP49418 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPHP49418 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPHP49418 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPHP49418 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPHP49418 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AMPHP49418 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AMPHP49418 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AMPHP49418 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AMPHP49418 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AMPHP49418 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AMPHP49418 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AMPHP49418 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
AMPHP49418 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AMPHP49418 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AMPHP49418 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
AMPHP49418 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
AMPHP49418 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPHP49418 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AMPHP49418 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AMPHP49418 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AMPHP49418 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AMPHP49418 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AMPHP49418 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AMPHP49418 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
AMPHP49418 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms