Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC11A1P49279 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms