Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX1P48742 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX1P48742 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX1P48742 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX1P48742 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX1P48742 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX1P48742 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX1P48742 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX1P48742 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX1P48742 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX1P48742 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX1P48742 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX1P48742 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX1P48742 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX1P48742 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX1P48742 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX1P48742 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX1P48742 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX1P48742 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX1P48742 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX1P48742 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX1P48742 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX1P48742 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX1P48742 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX1P48742 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX1P48742 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX1P48742 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX1P48742 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX1P48742 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX1P48742 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX1P48742 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX1P48742 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms