Protein–RNA interactions for Protein: P47076

RPC17, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC17P47076 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YCL019WYCL019W 5313 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 PSY2YNL201C 2577 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 MMS1YPR164W 4224 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 NFT1YKR103W 3657 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 MED2YDL005C 1296 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 PEX18YHR160C 852 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 BLS1YLR408C 369 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 RPL20AYMR242C 519 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 MUM2YBR057C 1101 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 AFT2YPL202C 1251 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 TRA1YHR099W 11235 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YKL100CYKL100C 1764 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 IRC3YDR332W 2070 nt2.61□□□□□ -1.99
RPC17P47076 FKS3YMR306W 5358 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 HBT1YDL223C 3141 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 RRG1YDR065W 1098 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 RPB9YGL070C 369 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 DAD2YKR083C 402 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 INP1YMR204C 1263 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 MPD2YOL088C 834 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YPL276WYPL276W 438 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 POL30YBR088C 777 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YSA1YBR111C 696 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YBR209WYBR209W 318 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 PSP1YDR505C 2526 nt2.6□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YLR001CYLR001C 2589 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 FIN1YDR130C 876 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 ARI1YGL157W 1044 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YIL054WYIL054W 318 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 BET3YKR068C 582 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 MSA2YKR077W 1092 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 REC102YLR329W 795 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YBL081WYBL081W 1107 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 ATP11YNL315C 957 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 YBL096CYBL096C 309 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 SSP2YOR242C 1116 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 PRM4YPL156C 855 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 SWD3YBR175W 948 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 SKO1YNL167C 1944 nt2.59□□□□□ -1.99
RPC17P47076 WHI3YNL197C 1986 nt2.59□□□□□ -2
RPC17P47076 VPS9YML097C 1356 nt2.59□□□□□ -2
RPC17P47076 MLH1YMR167W 2310 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 RGR1YLR071C 3249 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 SVL3YPL032C 2478 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 HPA3YEL066W 540 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 YGL138CYGL138C 1038 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 BRR6YGL247W 594 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 ADH4YGL256W 1149 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 TCD1YHR003C 1290 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 MRPL6YHR147C 645 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 SOL3YHR163W 750 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 PCL7YIL050W 858 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 MRPL38YKL170W 417 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 TAF4YMR005W 1167 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 YNL043CYNL043C 321 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 TEX1YNL253W 1269 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 ATG29YPL166W 642 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 SWC4YGR002C 1431 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 VHR2YER064C 1518 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 UTP15YMR093W 1542 nt2.58□□□□□ -2
RPC17P47076 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.57□□□□□ -2
RPC17P47076 DDI2YFL061W 678 nt2.57□□□□□ -2
RPC17P47076 SAY1YGR263C 1275 nt2.57□□□□□ -2
RPC17P47076 YJR020WYJR020W 333 nt2.57□□□□□ -2
RPC17P47076 SAS2YMR127C 1017 nt2.57□□□□□ -2
RPC17P47076 GPI2YPL076W 843 nt2.57□□□□□ -2
RPC17P47076 GRX1YCL035C 333 nt2.57□□□□□ -2
RPC17P47076 STE11YLR362W 2154 nt2.57□□□□□ -2
RPC17P47076 CWH41YGL027C 2502 nt2.57□□□□□ -2
RPC17P47076 SGS1YMR190C 4344 nt2.56□□□□□ -2
RPC17P47076 SPF1YEL031W 3648 nt2.56□□□□□ -2
RPC17P47076 ECM11YDR446W 909 nt2.56□□□□□ -2
RPC17P47076 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.56□□□□□ -2
RPC17P47076 ISC10YER180C 804 nt2.56□□□□□ -2
RPC17P47076 YIL161WYIL161W 708 nt2.56□□□□□ -2
RPC17P47076 LSM8YJR022W 330 nt2.56□□□□□ -2
RPC17P47076 ATG34YOL083W 1239 nt2.56□□□□□ -2
RPC17P47076 FIG1YBR040W 897 nt2.56□□□□□ -2
RPC17P47076 SAD1YFR005C 1347 nt2.56□□□□□ -2
RPC17P47076 RPN4YDL020C 1596 nt2.56□□□□□ -2
RPC17P47076 TAF2YCR042C 4224 nt2.55□□□□□ -2
RPC17P47076 RNH202YDR279W 1053 nt2.55□□□□□ -2
RPC17P47076 RPS25AYGR027C 327 nt2.55□□□□□ -2
RPC17P47076 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.55□□□□□ -2
RPC17P47076 YJR056CYJR056C 711 nt2.55□□□□□ -2
RPC17P47076 VMA6YLR447C 1038 nt2.55□□□□□ -2
RPC17P47076 YBL108WYBL108W 306 nt2.55□□□□□ -2
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