Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN1BP46527 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms