Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A1P43005 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A1P43005 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms