Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKARP32238 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKARP32238 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKARP32238 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKARP32238 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCKARP32238 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCKARP32238 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCKARP32238 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCKARP32238 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCKARP32238 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCKARP32238 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms