Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA9P31269 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms