Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD10P28358 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXD10P28358 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms