Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2CP19387 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2CP19387 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms