Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCAM1P19320 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCAM1P19320 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms