Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms