Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MS4A1P11836 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A1P11836 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms