Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC192P0DO97 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms