Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP1P09874 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP1P09874 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP1P09874 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP1P09874 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP1P09874 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP1P09874 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP1P09874 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP1P09874 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP1P09874 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP1P09874 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP1P09874 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP1P09874 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP1P09874 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP1P09874 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP1P09874 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP1P09874 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARP1P09874 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP1P09874 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP1P09874 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP1P09874 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP1P09874 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP1P09874 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP1P09874 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP1P09874 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP1P09874 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP1P09874 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP1P09874 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARP1P09874 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARP1P09874 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARP1P09874 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARP1P09874 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARP1P09874 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARP1P09874 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARP1P09874 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARP1P09874 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms