Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIA3O75145 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms