Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KPNA3O00505 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms