Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ints10-204ENSMUST00000110242 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Pcdhb4-201ENSMUST00000056712 3718 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 Zcchc12-201ENSMUST00000048067 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Oprm1-217ENSMUST00000105615 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Trim35Q8C006 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Rnf111-207ENSMUST00000215848 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 St5-202ENSMUST00000079282 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Rrn3-201ENSMUST00000023363 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Prc1-201ENSMUST00000047558 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trim35Q8C006 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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