Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A4Q9Y6R1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms