Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRAPPC8Q9Y2L5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms