Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP20Q9Y2K6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms