Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZRN3Q9UPQ7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZRN3Q9UPQ7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms