Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACAD8Q9UKU7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACAD8Q9UKU7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACAD8Q9UKU7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACAD8Q9UKU7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACAD8Q9UKU7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ACAD8Q9UKU7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACAD8Q9UKU7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACAD8Q9UKU7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms