Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXL2Q9NZ53 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PODXL2Q9NZ53 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms