Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC10Q9NYD6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC10Q9NYD6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXC10Q9NYD6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms