Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM161AQ9NX61 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM161AQ9NX61 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms