Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDHAF2Q9NX18 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms