Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM30AQ9NV96 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30AQ9NV96 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms