Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms