Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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