Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPH6AQ9H0K4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH6AQ9H0K4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms