Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFIH1Q9BYX4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms