Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM55Q9BYV6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms